¿Cómo colocar o poner el logo en la cabecera de la web y eliminar la página de inicio del menú?

Ambas acciones puedes crearlas desde la opción de personalizar dentro de tu administrador de WordPress.

En la opción «Encabezado«.

Ver respuesta completa y ejemplo en:

La Sesión en Vivo de Preguntas y Respuestas del 30 de abril de 2020 (minuto 09:40)